Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FiglaO55208 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FiglaO55208 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms