Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms