Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ArxO35085 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ArxO35085 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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ArxO35085 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ArxO35085 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms