Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Casq1O09165 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casq1O09165 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms