Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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