Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5458L7N219 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms