Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrna9G3X8Z7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna9G3X8Z7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms