Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XntrpcF8VQM8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms