Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm28048F7BCN0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm28048F7BCN0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm28048F7BCN0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm28048F7BCN0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm28048F7BCN0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm28048F7BCN0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm28048F7BCN0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28048F7BCN0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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