Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm8005F6YKY3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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