Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm17555F6U8B9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17555F6U8B9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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