Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms