Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20425E9Q035 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms