Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3298E9PW80 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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