Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms