Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms