Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6133B2RY53 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6133B2RY53 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms