Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Usf3B2RUQ2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms