Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol7aB2RT54 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apol7aB2RT54 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms