Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palm3A2TJV2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms