Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms