Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Robo3Q9Z2I4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms