Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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