Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms