Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms