Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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