Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tmod4Q9JLH8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms