Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms