Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ap3m1Q9JKC8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms