Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ush1cQ9ES64 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms