Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms