Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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