Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb2bQ9CWF2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb2bQ9CWF2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms