Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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