Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms