Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpgs1Q99MS8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpgs1Q99MS8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms