Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms