Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Vrk3Q8K3G5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Vrk3Q8K3G5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Vrk3Q8K3G5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Vrk3Q8K3G5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Vrk3Q8K3G5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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