Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Abcf3Q8K268 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Abcf3Q8K268 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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