Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LgsnQ8CIX8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms