Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClasrpQ8CFC7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ClasrpQ8CFC7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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