Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8C1

Rtp1, Receptor-transporting protein 1, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp1Q8C8C1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp1Q8C8C1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtp1Q8C8C1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtp1Q8C8C1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rtp1Q8C8C1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rtp1Q8C8C1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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