Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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