Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Defa22Q8C1N8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Defa22Q8C1N8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Defa22Q8C1N8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Defa22Q8C1N8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Defa22Q8C1N8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Defa22Q8C1N8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa22Q8C1N8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Defa22Q8C1N8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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