Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdca8Q8BHX3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms