Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms