Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms