Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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