Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Timd4Q6U7R4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Timd4Q6U7R4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Timd4Q6U7R4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Timd4Q6U7R4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Timd4Q6U7R4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Timd4Q6U7R4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Timd4Q6U7R4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Timd4Q6U7R4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Timd4Q6U7R4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Timd4Q6U7R4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Timd4Q6U7R4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Timd4Q6U7R4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Timd4Q6U7R4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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