Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Sohlh1Q6IUP1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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